自然疗法作为一种追求整体健康的治疗方式，其根源可以追溯到古代文明中的传统医学实践。在不同的文化和地域中，人们通过观察自然界的现象和动植物的特性，发展出了各种以天然物质为基础的治疗方法。这些方法强调的是利用大自然的资源来促进身体的自我修复能力，而不是依赖药物或手术等人工干预手段。

在古埃及，草药被广泛用于医疗目的，而顺势疗法（一种使用极微量药物激发身体自愈能力的治疗方法）的思想也可以在该时期的文献中发现。古希腊的希波克拉底被认为是西方医学之父，他主张预防疾病的重要性，提倡通过饮食、运动和生活方式的调整来实现身体健康。同时，他的学生也发展了针灸和按摩等技术来进行治疗。

中国传统的中医学则是另一座自然疗法的大厦。它起源于大约2000年前的春秋战国时期，形成了独特的理论体系和诊疗方法。中医强调阴阳平衡、五行相生相克以及经络系统的调节作用，采用草药、针灸、推拿等方式来达到治疗效果。印度的阿育吠陀医学同样重视自然元素对人体健康的影响，包括使用草药、瑜伽、冥想和其他身心调理的方法。

随着科技的发展和社会的变化，自然疗法在近现代得到了更多的关注和发展。19世纪末，美国的安德鲁·泰勒·斯旺森医生提出了“自然治愈力”的概念，认为人体有能力自行康复，只要提供适当的营养和环境条件即可。这一观点为后来的有机农业、素食主义和替代医学等领域奠定了基础。

到了20世纪初，随着工业化带来的环境污染和对化学药品副作用的认识加深，越来越多的人开始寻求更加温和的自然疗法来维护健康。例如，德国的亨利·埃尔莫尔博士创立了生物动力农法，旨在通过有机种植和土地管理恢复土壤的健康和活力；美国的约翰·R. 普拉特医生则推广了脊椎指压疗法，这是一种通过调整脊柱结构来改善神经系统功能的非侵入性治疗方法。

进入21世纪后，人们对自然疗法的兴趣持续增长。许多国家建立了专业的自然疗法学院和教育项目，培养了一批专业人才。同时，政府也开始对自然疗法进行监管和支持，将其纳入医疗保险范围，使得更多的人能够享受到这种安全有效的治疗选择。